শিক্ষা জাতির মেরুদণ্ড, দিক নির্দেশক ও সার্বিক উন্নয়নের সোপান। কিন্তু যে শিক্ষার মাধ্যমে জাতির মেরুদণ্ড সুগঠিত হয়ে সমন্বিত উন্নয়নের ভিত্তিমূল দৃঢ় করে, তার অন্যতম দায়িত্ব শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের। সেই কাংখিত গুণে গুণান্বিত শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের সংখ্যা প্রয়োজনের তুলনায় খুবই অপ্রতুল। ব্যাপক এ চাহিদা পুরনের লক্ষ্যে দেশের দ্বি-মূখী শিক্ষা ব্যবস্থার প্রেক্ষাপটে ইসলাম ও আধুনিক শিক্ষার সমন্বয় সাধন করে ইসলামের আদর্শিক বুনিয়াদের ভিত্তিতে পাবনা ইসলামিয়া মাদরাসা গড়ে উঠেছে।
আধুনিক শিক্ষা ব্যবস্থায় ইসলামকে সঠিকভাবে জানা, বুঝা ও শিক্ষা গ্রহণের কোন ব্যবস্থা নেই, অন্যদিকে মাদরাসায় ইসলামকে একটি পূর্ণাঙ্গ জীবন বিধান হিসাবে শিক্ষা দেওয়ার মত ব্যবস্থা আজও গড়ে উঠেনি। ইসলামী জীবন দর্শন, সংস্কৃতি, ঐতিহ্য, মূল্যবোধ, অর্থনীতি, রাজনীতি ও সমাজনীতি ইত্যাদি সম্পর্কে মুসলিক তরুণদেরকে আদর্শ মুসলিম নাগরিক রূপে গড়ে তোলার সুযোগ এখনও সৃষ্টি হয়নি। বিশেষ করে নৈতিক অবক্ষয় থেকে তরুণ সমাজকে রক্ষা করে চারিত্রিক উৎকর্ষতা ও মূল্যবোধ সৃষ্টির কোন কার্যক্রম আমাদের শিক্ষা ব্যবস্থায় নেই। এই নিদারুন আদর্শিক দৈন্যতা ও নৈতিক বিপর্যয় থেকে মুসলিম উম্মাহর ভবিষ্যত বংশধরদের রক্ষা করা এবং যথাসম্ভব এ অভাব পূরণের জন্য বিশিষ্ট ইসলামী চিন্তাবিদ, প্রবীণ রাজনীতিবিদ ও তৎকালীন জাতীয় সংসদ সদস্য আলহাজ্ব মাওলানা মুহাম্মাদ আব্দুস্ সুবহান সাহেব তাঁর কয়েকজন সহযোগিদের নিয়ে পাবনা শহরের প্রবেশদ্বারে প্রাকৃতিক সৌন্দর্যমণ্ডিত ও যান্ত্রিক কোলাহল মুক্ত মনোরম পরিবেশে দারুল আমান ট্রাস্টের মাধ্যমে ১৯৯৩ সালে এ মাদরাসাটি প্রতিষ্ঠা করেন। প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকেই মাদরাসাটি সুনামের সাথে পরিচালিত হয়ে আসছে। অদূর ভবিষ্যতে মাদরাসাটিকে আবাসিক কামিল মাদরাসাতে উন্নিত করার পরিকল্পনা রয়েছে।